泵啟動后，在離心力的作用下，吸水室中的剩余液體與進液管路中的空氣被葉輪攪拌形成氣液混合物，混合物通過蝸殼進入氣液分離室，隨著流速降低，導致氣水分離，空氣由泵出液口排出，液體經回流孔返回泵腔內，經過多次循環，進液管道中的空氣被逐漸排空，使泵腔內形成一定的真空度。

　　低位槽中的液體在大氣壓的作用下流向泵進口，達到自吸的作用，這一系列的自吸過程是泵在剛啟動的1至3分鐘內自動完成，無需人工干預，當液體充滿泵的進液管路與泵腔后泵組即自動進入正常運行狀態。磁力自吸泵的驅動裝置采用主動磁鐵聯軸器直接裝在電機軸上，通過磁力偶合間接驅動轉子組合上的葉輪旋轉，泵腔全部封閉，完全無泄漏。